由于地区不同采收季节各有所异。四川裁后第二年5月下旬至6月上旬采收。北京栽后第二年8月上旬采收。云南第二年10～11月间地上部枯萎后采挖，选择晴天，除去落叶，剪须根，泥土，节子(芍苓子)留作种苗不能日晒。按大小分开，用慢火烤干或晒干，干后放在竹箩内摇撞，撞去外粗皮、须根、泥土即可。
川芎采收后应及时干燥，通常采用火炕烘干。上炕后，用慢火烘烤，烘干过程注意经常翻动，烘8~10小时后取出，堆积发汗，再放入炕床，改用小火炕5~6小时，烘干;烘炕温度不得超过70℃。，经2~3天后，散发出浓郁的香气时，取出放在竹筐内抖撞或放入用竹编的撞笼内抖撞，除去泥沙和须根即成川芎。
