1、高温高湿气候适宜水稻种子发芽
有经验的农民朋友应该都知道，水稻种子的成熟度愈高，发芽率就越大，从现在的数据来看，水稻种子成熟的时间需要25天，萌芽适宜的温度是30度到35度，最低也需要10度以上。同一种植物种子开花部分是不同的，所以导致了开花成熟的时间有前有后，充分成熟的种植休眠比较容易发育，而没有充分成熟的种植休眠不易发芽。
2、不当的收获时间
我们知道水稻的休眠期不是非常明显，如果水稻收获得过早，种子并不能完全成熟，在非完全干燥的环境下，种子仍然有呼吸作用，这样种子对营养的消耗费非常大，从而导致了种子发芽率低；如果水稻收获得过晚了，种子在高温高湿的环境下，会直接萌芽，从而导致了发芽率低；另外种子的水分含量也会影响种子的发芽率，如果种子水分含量过多，会加速种子的老化，从而导致发芽率低。
3、种子的晾晒过程中的不当操作
我们知道水稻种子在收获后并不是直接储藏的，而是要进行晾晒和清理杂质这两步以后才能储藏。不过种子的数量多，在农村进行种子收获后处理的场地有很大限制，缺少一定的干燥设备，所以农民朋友在晾晒种子的时候没有及时翻动，会导致种子的胚芽烧坏，使得种子失去活力，从而导致种子发芽率低。
4、收获加工过程中机械破坏种子
收获水稻的过程中，我们经常会用机械来处理和加工，这时候一些水稻的品种非常容易出现脱壳现象，缺乏种皮保护的种子非常难发育，即使发芽成功了，在田间还是非常容易腐烂的。
