危害性状水稻茎线虫主要是深水水稻和非灌溉水稻的重要病原，但在浅水水稻中也发现有此线虫的报道。通常直播稻田此病发生重，移栽秧苗的稻田发病轻。大田表现的症状常在移栽秧苗后的1－2个月发现。至孕苗期，遭水稻茎线虫严重侵染的叶鞘内散穗花序封闭，受侵染的部位茎出现分叉，或者花序扭曲变形、花梗表现为失绿、黑褐色，仅在靠近顶尖的部分形成正常的谷粒，而其他的种子扭曲变形、皱缩不孕或小穗空谷。被严重侵染的作物可表现为生长停滞、严重的矮化以及时片萎蔫。生物特性
在16℃时，水稻茎线虫就开始活动、侵染寄主，在孟加拉国．水稻茎线虫的繁殖主要发生于5月、6月和11月，一年至少发生3代。雨季水稻茎线虫病严重发生：低温、干旱的季节由于线虫的迁移和繁殖受到抑制或减少，水稻较少受到此线虫的侵染．传染途径水稻茎线虫外寄生于水稻或其他寄主植物组织的幼嫩部分，未发现由寄生于植物的组织内。在潮湿的季节，水稻茎线虫可以在水中沿着水稻的幼苗迁移，并侵入到水稻的生长点，在水稻秧苗插入后几天内，顶芽的生长点就可发现此线虫。此线虫能随着植株的生长点不断向上转移，取食新形成叶鞘内的组织细胞。在水稻开花抽穗期间，发现线虫主要存在于叶鞘、茎节、花梗、散穗花序和种子周围的幼嫩茎部分。疫区水稻的各个生长阶段均可发现水稻茎线虫的成虫、幼虫和卵各个时期。
在寄主植物即将成熟或干旱季节即将来临时，水稻茎线虫变得不活动，潜藏于干颖壳及残茬内，形成棉花团状的间生态。这种休眠状态的线虫能在干燥的条件下存活达6－15个月之久。当遇到潮湿的条件或遇水浸渍时，线虫又复苏活动，再遭干燥又蛰伏不动。
收获水稻后病田内的根茎、根蘖、病株残余、其他野生寄主及被污染了由土壤均可传病，成为次年的初次浸染来源。稻谷谷粒上也能发现此线虫。水稻茎线虫可由土壤侵入到稻苗，然后随病秧苗移栽到大田。在田间此病原可通过田间的灌水、排水及雨水传播。在气候潮湿时，病株茎叶上的此线虫可通过相互接触摩擦而传播。
防疫方法严格禁止从水稻茎线虫的疫区进口稻草或用稻草编织的草袋、草席、草绳等制品。在进口的货物中．不得使用疫区的稻草或稻草制品以及土壤作为货物的填充物，一旦发现．立即烧毁。将货物中夹带的稻草或稻草制品及土壤用浅盘法或贝尔曼漏斗法分离线虫，如发现线虫则进一步鉴定是否为水稻茎线虫。
