辣椒病毒病也称花叶病，在田间的四种典型症状是花叶、黄化、坏死和畸形。
花叶，即叶片上出现黄绿相间或叶色深浅相间的症状，叶色褪绿，严重的叶面皱缩，叶片细长呈线状，植株矮化，果实表面黄绿相间。黄化，即病株叶面明显呈黄色，叶片枯死，造成脱落。坏死，即植株病部组织变褐坏死，发病叶面出现坏死条斑，病茎部出现坏死条斑或环斑。发病严重时，引起落果，甚至造成植株枯死。畸形，即叶片颜色深浅相间，后叶片细长呈线状，增厚，植株明显矮化，分枝增多，产生丛枝，发生严重时使植株变形。同一植株可能多种症状并发，造成植株落叶、落花、落果，甚至使植株枯死。在防治上应掌握以下四点：
(一)选栽抗病品种，如嘉配5号甜椒、海丰1号甜椒、双丰甜椒、上海圆椒和上海甜椒等。
(二)播前对种子进行处理。从无病留种株上采收种子，选用无病种子。引进商品种子在套种前要做好种子处理，可在播种前先用10%磷酸三钠溶液浸种20～30分钟，再用清水冲净药液后晾干催芽播种。
(三)加强套种田间管理。适时播种，培育壮苗，移栽前先对小麦、果树防治一遍蚜虫和飞虱。合理密植，施足基肥，促进植株健壮，提高抗病能力。及时清理田边杂草，经常喷药，不要只盯着辣椒上的虫害，而应提前预防小麦、果树上的虫害，减少病毒来源。
(四)在发病前或麦收期间抓紧喷施菌毒杀星(高浓度)3000倍液(每亩用药量10～20克)、20%病毒A可湿性粉剂700～1000倍液(每亩用药量100～150克)喷药预防，每隔7～10天喷1次，连喷2～3次，可减少套种田辣椒病毒病的发生，增强植株抗性。
