苗期、成株期均可发病。幼苗染病，子叶顶端枯死，后扩展到幼茎，幼茎缢缩变细，易自病部折断枯死。发病重的幼苗成片死亡，严重的有毁棚的可能。真叶染病出现半圆至近圆形淡褐色轮纹斑，后期叶片或茎部均可长出灰霉，致病部腐烂。成株染病，叶缘处先形成水浸状大斑，后变褐形成椭圆或近圆形浅黄色轮纹斑，密布灰色霉层，严重的导致大斑连片，整叶干枯。果实染病，幼果果蒂周围局部先产生水浸状褐色病斑，扩大后呈暗褐色，凹陷腐烂，表面产生不规则轮纹状灰色霉状物。
当棚内低温(20～30℃)、高湿(空气湿度达90%)通风不良，定植密度过大，管理不当，植株抗病性差等发病较重。病菌在病残体及土壤中越冬，借气流、灌溉水及农事传播，从伤口衰老或死亡，组织入侵。
防治方法是：大棚温室及时通风，浇水安排在晴天上午进行，适当控制浇水量，切忌大水漫灌。
发病初期可喷洒50%速克灵可湿性粉剂1500倍液、50%农利灵可湿性粉剂1000倍液、40%多硫悬浮剂500倍液，在阴雪天气等不良的环境条件下，可用10%速克灵烟剂，每亩每次250克，或5%百菌清粉尘剂，每亩每次1公斤，但此时一定注意要在熏棚的第二天及时通风，避免产生药害反而影响甜椒正常生长。
另外还可在甜椒蘸花时，在生长调节剂中加入0.1%的50%速克灵可湿性粉剂、50%扑海因可湿性粉剂，预防辣椒灰霉病的发生。
