金针菇袋式栽培，就是用塑料袋作栽培容器，老法是一头出菇种植，不能充分利用空间，产量低。新法两头出菇产量高，效益好，成本也低。袋式栽培包括装料、发菌和出菇。通常把装料发菌的过程叫菌袋培养。金针菇袋栽的关键是菌袋培养，包括拌料、装袋、灭菌消毒、接种和发菌培养。根据灭菌方法不同，选用不同质量的塑料袋装。如用高压蒸气灭菌，选用耐高温高压的聚丙烯塑料，常压蒸气灭菌可用低压聚乙烯塑料。料袋筒宽17厘米，长35厘米。培养料常用的配方比例：棉籽壳89%，麸皮10%，石膏或碳酸钙1%。料与水的比例是1∶1.4-1.5。搅拌后达到手握成团，手松散开为宜。玉米芯栽培料的配方：玉米芯73%，麸皮25%，石膏1%，蔗糖1%。料与水比例为1∶1.4-1.5。装入袋内的培养料一般300，500克。把料袋放人蒸锅内，水温烧到100℃，经8-10小时，可达到灭菌要求。用消过毒的料袋接菌种。栽培金针菇和种庄稼一样，选好良种才能高产。好的菌种有旺盛的生命力，能抑制杂菌生长。接种时点燃酒精灯，用灭过菌的镊子将原种或栽培种弄碎，在点燃酒精灯的无菌区内，打开料袋两头的扎口，分别接入原种或栽培种，接种完毕用绳把袋口扎住。全部过程要在无菌条件下操作。金针菇生长阶段需氧不多，通常采用封闭式的发菌培养。
菌丝生长适宜的温度是23-25℃。十般袋内温度比室温高2℃左右，培养室的温度不能低于20℃。建造地沟菇房或半地下房式菇房，有利于保持适宜的温、湿度。在农村利用房前屋后空地，选择地势高、向阳、地下水位较低的地方挖沟建菇房。沟宽4米，深2米，顶棚覆盖塑料布和作物秸秆，正对沟中间人行道及四周设通风口，以便调节通风、透光和温度。地沟内放三排床架，床架宽40厘米，高2米。床架用竹竿铺设5层，层间距离40厘米，每层可横向堆放4层料袋。使用前，床架要进行消毒处理地沟菇房以土做墙壁，土是热的不良导体，有利于保持菇房恒温，土还是水的良好载体，有利于菇房保持湿度。地沟菇房较暗，有利于菇体保持白色。菇房使用前要消毒，常用的消毒剂有石碳酸、来苏儿和漂白粉等。发菌阶段的菇房温度应保持在23-25℃，冬季要采取加温措施。相对湿度保持60%左右。湿度太大易生杂菌，每天定时通风，有利菌丝生长。接种10-15天，菌丝生长量小，呼吸量也小，菌袋内氧气可满足需要。当料袋菌丝增多，长到5厘米左右，代谢活动随之加强，需氧量增加，这时应解开菌袋两头扎口，增加通气，促进菌丝生长。为了促使发菌均匀，每隔10天将床架上下层和里外的菌袋调换1次位置，菌丝长满料袋时，要敞开袋口，以利出菇。菌丝由孢子长成，生长30天左右长满料袋就开始出菇了。从接种到菇体长成大约要两个月。进入出菇管理，温度要降到10-12℃，低温对出菇有利。相对湿度保持90%。湿度不够时，可往地面喷水，但不要喷到菇体上，以防烂菇。出菇阶段要控制好通风、透光、温度、湿度和二氧化碳浓度。若管理不善，会出现畸形菇。比如，有的菌盖很小，人们叫它针头菇，这是因为二氧化碳浓度过高造成的。如果通风太强，菌盖长的太大，也不符合商品菇的要求。菇体颜色好，菌柄长到10厘米以上，菌盖直径达到1厘米就可以采收了。采收时，一手按住袋口，一手轻轻抓住菇丛拔下，平整地放入筐内。刚采下的菇要剪去菌柄基部，放在光线暗、温度低的地方，以便储运销售。也可把鲜菇放在铝锅内煮沸，盐渍储存。
