首先选用不易产生畸形果的品种。如红玉、红宝、西粉3号、佳红、丽春等。
其次合理使用植物生长调节剂。当幼苗期出现徒长时，不能只依靠控水和降温来控制苗子旺长；而应在搞好温度、光照、水分调节的基础上，喷施促花王3号进行控制枝条疯长，迫使顶梢旺盛营养大量回流，其主干主力营养转向幼果发育系统，提升果实膨大活力。
再次给西红柿浇水时冲施免深耕，按30毫升加15千克水的比例，随水冲施；也可结合追施有机肥，适时在西红柿幼果期和膨大期喷施新高脂膜和菜果壮蒂灵，增强土壤的透气性，提高西红柿吸肥吸水能力。
最后发现子粒外露果，应及时摘除，为防止继续出现畸形果，建议喷施新高脂膜500倍液配合速效硼或印度钙混合液，6天1次，连续2～3次，对防治西红柿畸形果实子粒外露有较好的效果。
