马水桔新梢黄化常由多种因素引起，主要问题出现在根部，如土壤酸化板结，重金属超标、土传病虫害，果树缺肥、缺微量元素，果园长期积水等，最常见的症状则是根系不发达及根腐烂。
如果当初开坑种植时没有施入足够的有机基肥，在往后的施肥中只施入氮、磷、钾等的大量元素，而植株所需要的其它中微量元素贫乏，土壤的保肥保水能力差，植株长势会越来越差，植株的抗病能力也变弱。此外，当土壤严重缺钙后，植株的叶片在叶尖、叶缘出现了黄化变褐色。严重时叶片会提前脱落，枝梢枯死。
如果植株出现烂根，可用50%琥胶肥酸铜可湿性粉剂，与70%敌克松可溶性粉剂400倍液、25%甲霜灵可湿性粉剂300倍液，对植株进行灌根，让药液渗入泥土根部，每隔10天交替用药灌根1次，连续灌2-3次。建议每隔15天对树冠喷一次优质叶面肥，连续喷2-3次，最好选择在旁晚时进行，以利植株更充分地吸收，提高植株本身对病害的抵抗能力，以促进新根的抽出。
