芹菜营养生长最快的时期是，日平均温度14-20摄氏度，旺盛生长期内，必须供给充足的肥水。加之芹菜的主要食用部分是叶柄，叶柄以嫩而脆者为好。在高温、干旱、缺肥时，会使叶柄品质降低。所以芹菜定植后一经封垄，开始旺盛生长时就要轻肥勤施，小水常浇，要多施氮肥，最好用腐熟的人粪尿。如能在蹲苗后每亩施100公斤饼粕，不仅能提高产量，而且叶柄肥嫩，风味好。
经验证明，任何时期缺乏氮、磷、钾，都比施用完全肥料的生育差，而初期和后期缺氮的影响最大，初期缺磷比其他时期缺磷的影响大，初期缺钾的影响小，后期缺钾的影响大。因此后期也应补施钾肥。缺氮不仅使生育受阻，植株长不大，而且叶柄易老化空心。芹菜甚需硼，缺硼则会使叶柄发生“劈裂”。
