1、立枯病
立枯病多在温度较高的苗棚零星发生，造成局部死苗。此病主要为害幼苗茎基部和根茎部。初在茎基部产生椭圆形或不规则形褐色坏死斑，逐渐向下凹陷，边缘明显，绕茎一周瓜苗即萎缩死亡。根茎染病，皮层组织变褐腐烂，地上部随病情发展萎蔫枯死。空气潮湿，病部表面产生不明显的灰褐色蛛丝状霉层，即病菌菌丝体。
2、猝倒病
育苗期间遇阴雨天气多发生严重。此病自播种后即可发生，早期染病种子发芽即坏死腐烂，不能出土。出苗后露出土表的幼茎基部染病成水渍状，迅速软化腐烂并缢缩，随后幼苗倒伏。有时瓜苗出土胚轴和子叶已腐烂变褐枯死。潮湿时病部产生少许絮状菌丝，病害严重时常造成幼苗成片死亡。
3、根腐病
根腐病亦为甜瓜的常见病，多发生在土壤较黏重的地区。以分苗或定植后缓苗前较为常见，苗肥或底肥未充分腐熟，或因其他原因造成根伤较多，此病严重。此病主要侵染根和根茎，染病部位初呈水渍状，以后呈黄褐色坏死腐烂。湿度大时根茎表面产生白霉，其病部腐烂处维管束变褐，但不向上发展而区别于枯萎病。随病害发展病部略收缩变细，植株或幼苗叶片由下向上逐渐褪绿萎蔫最后枯死。后期病部全部腐朽，仅剩下丝状维管束组织。
