大多数山药没有种子或种子基本无生命力，常用的繁殖方法是无性繁殖。用于繁殖后代的营养体被称作种薯，常用的种薯有山药栽子、块茎切段和零余子。山药完整块茎最上端有芽的一截被称作山药栽子，通常在块茎收获时被单独掰下，留作种薯。对于不结零余子的品种，在扩大种植规模时，由于栽子数量有限，块茎切段便成为主要种薯。零余子也是重要的种薯，山药连年进行无性繁殖，种性会出现退化。为解决种性退化问题，常用零余子更新复壮，改善山药品质。用零余子作种薯的优点是种源广、成本低、后代生活力旺盛、病害少、增产显著；缺点是需要两年，第一年只能长成10—300克的种薯（山药栽子），第二年栽子作种薯才能成商品山药。
