准备贮藏的大蒜应在叶片开始变黄时选晴天适时采收。收获时，先将大蒜下面的土壤刨松，以便植株易从土中拔出。收获后，将大蒜堆成堆，以蒜叶覆盖蒜头晒2~3天，待蒜秸开始萎蔫时，修剪根瓣，剪去根茎，然后将蒜头放入筐内。最好将蒜头暴晒或人工干燥。人工干燥以30%的温度，50%左右的空气相对湿度为宜，这有利于加速蒜头干燥，促进休眠，延长贮藏期。
选择地势较高、干燥、土质坚厚、地下水位低的地块挖窖。在窖底铺一层蒜，堆一层草，但堆积的厚度不可过高，以便通风。窖内安设通风道，窖藏期间要定期检查，随时除去腐烂或变质的蒜头。此法利用窖的低温和低湿等条件使大蒜有一个稳定的贮藏环境。
贮藏蒜种可在表土结冻前，选择地势较高的背阴处挖贮藏沟，沟深50~60厘米，沟宽60~70厘米，沟长可根据贮量的多少而定。在当地气温降至-12℃时，开始入沟贮藏。贮藏前2~3天，将蒜种充分晾晒，以减少蒜种的含水量。
埋藏时，将沟底用砖头或木棍等垫起，高5~10厘米，然后将蒜头堆放在上面，堆至距地表15~20厘米处。蒜头上面用木棍、纸壳、草苫子搭棚，四周再用土埋严，以防透风。
贮藏期间温度应控制在0~10℃，当温度低于-10℃时，应加盖草苫保温，待温度回升后再及时撤掉。冬季降雪后，要在雪融化前将积雪清除干净，防止雪水流入沟内。
