1、疫病
疫病主要危害冬瓜果实，发病时果实出现水渍状病斑，病斑外围有一圈白色霉斑，将病变位置剖开，会发现里面的果肉已经发褐，如果不及时处理，最终整个果实腐烂。
防治方法：此病是通过病菌在土壤中存活越冬，在来年时通过雨水传播，选择生长强健、抗病力强的品种，越冬前将土壤深翻消毒，杜绝病菌安全存活越冬。在果期定时喷洒药剂防治，发病时喷洒康博药剂治疗。
2、蔓枯病
蔓枯病主要发生在18-25度、高湿的环境中，发病时叶片出现褐色病斑，出现黑色小斑点，茎节长有病斑，变色为黑色，溢出黄褐色的分泌物，发病严重时茎叶腐烂成乱麻状。
防治方法：种植前用福美双可湿粉剂进行拌种，消灭种子表面的病菌，减少病害的发生几率，轮作，控制土壤湿度，及时排水，定期用药剂喷洒防治，发病时用百菌清治疗。
3、枯萎病
枯萎病和疫病疫病的发作条件类似，也是病菌在土壤中安全越冬，通过各种途径传播，特别在湿度较大的环境发病率高。发病时叶片开始褪色萎焉，湿度较大时出现粉色或白色的霉菌，茎基部湿腐，内部变褐，最终最终因枯萎而亡。
防治方法：同样的将种子进行消毒处理，将越冬前将土壤深翻晒白，实行轮作，定期喷洒药剂防治，发病时用琥胶肥酸铜可湿性粉剂灌根治疗。
