一忌出池后立即施用若出池后立即施用，会与作物争夺土壤中的氧气，影响种子发芽和根系发育，导致作物叶片发黄、凋萎。因此，沼肥出池后，一般先在储粪池中存放5~7天，才可以施用。
二忌不兑水直接追施沼肥不兑水直接施在作物上，尤其是用来追施幼苗，会使作物出现灼伤现象。沼肥作追肥时要先兑水稀释，一般按1：1兑水稀释。
三忌施于土表沼肥施与旱地作物宜采用穴施、沟施，然后盖土。施于水田应在耕整前均匀撒施于田面，然后用犁翻入底层。
四忌过量施用施用沼肥的量不能太大，若盲目大量施用，会导致作物徒长，行间阴蔽，造成减产。
五忌与草木灰、石灰等碱性肥料混施草木灰、石灰等碱性较强，与沼肥混合会造成氮素损失，从而降低肥效。
六忌用酸化池、不产气池的沼液施肥。
七忌在炎热中午或下雨前进行沼液叶面喷肥。
