防除水稻秧苗浮萍，可以选用吡嘧磺隆、苄嘧磺隆、灭草松、2甲4氯等药剂。2甲4氯应在水稻4叶期至拔节前施用。
防治青苔通常采取以下土办法：一是排水晒田，让青苔脱水枯死。也可在中耕时用手将青苔塞入泥中，使它得不到阳光，青苔不能进行光合作用而死亡。二是在青苔上撒一层草木灰，因草木灰含碱，能导致青苔死亡。也可撒施茶枯粉，以提高稻田的碱性，使适宜酸性环境的青苔无法生长。还可将鲜枫树叶、苦楝叶、松针捣碎，连汁带渣施于田间，保持2~3厘米水层，让树叶浸出的碱性物质杀死青苔。
也可采用化学药剂防除。适合防除稻田青苔的农药有：硫酸铜、青苔净、稻思达。建议对照药品使用说明书用药。
