1、栽培环境不合适
甜瓜是喜光、喜水的热带作物，低温弱光、高温干旱，特别是连续阴天，其根系受到损伤或伸展受到阻碍，导致吸收的水分和养分少，生长极为缓慢，影响糖分的转化，会在根系和瓜中积累更多的苦味素，形成苦味瓜。
2、施肥浇水不合理
有机肥施用过少，氮肥施用过多，磷、钾肥施用不足等，都易出现苦味瓜。水分不足或过多，都不利于甜瓜的生长发育，容易出现苦味瓜。
3、坐瓜灵施用不当
在生产中，为防止落花、化瓜，瓜农多采用坐瓜灵进行蘸花、喷雾处理。但若坐瓜灵施用不当，易使甜瓜产生异味甚至苦味。施用坐瓜灵后，甜瓜生长速度明显加快，果实很快就会长到商品果大小，若采收过早，也易产生苦味等问题。
4、嫁接后管理不当
嫁接的甜瓜，生长势往往较强，如果管理不当，造成长势过旺，会影响糖分的转化，造成苦味产生。
5、坐瓜节位不当，负载量大
坐果节位过于靠近根部或稍部、留瓜太多负载量大，都会影响苦味素的转化，使成熟的甜瓜带有苦味。
6、采收过早
有些种植户为了提早上市，在甜瓜未成熟时就采摘，导致苦味未转化完全。
甜瓜苦味产生的原因有多重，往往是栽培措施和环境因素同时影响的结果，与种子质量本身没有关系。
