生菜菌核病主要危害茎基部。最初病部为黄褐色水渍状，逐渐扩展至整个茎部，使其腐烂或沿叶帮向上发展引起烂帮和烂叶，最后植株萎蔫死亡。保护地内湿度偏高时，病部产生浓密絮状菌丝团，后期转变成黑色鼠粪状菌核。防治办法：1.改平畦栽培为起垄栽培。现在，菜农在大棚里种植生菜大多同露天种植生菜一样，采取平畦栽培，这样通风差，容易积水，所以发病重。
2.及时清理病残烂叶。发现病株及时清理，并将带病菌的烂叶埋入土壤深层，减少病菌进一步侵染。
3.土壤处理。对多年种植生菜的大棚，在麦收后高温季节，可采用石灰氮闷棚对土壤高温消毒。
4.药剂防治。定植前在苗床用25%粉锈宁可湿性粉剂4000倍液喷洒。发病初期，及时清除病株病叶，用65%甲霉灵可湿性粉剂600倍液、50%多霉灵可湿性粉剂600倍液或40%菌核净可湿性粉剂1200倍液喷洒，重点喷洒茎基部叶片。
