发病植株根、茎、叶均与正常瓜无异，但敲击时声音发闷，似敲打软木的扑扑声，与正常成熟瓜、生瓜有异。剖开后发现瓜肉呈紫红色，浸润状，果肉绵软，同时能闻到酸甜气味。从果实的外观分辨病瓜，仅可从瓜蒂部分看到蒂部颜色呈深褐色，瓜把茸毛脱落较早，此外无任何症状。
预防措施：
1、及时放风、排湿、降温。平时放风，控制棚温在30℃以下，坐果后15-25天这段时间，西瓜膨大，并开始转色，是管理的关键时期。此时只要棚温不低于20℃，均要进行放风。浇水后，应将棚顶薄膜缝隙全部扒开，连续3天保持棚内无水汽。如遇高温天气，还应打开棚的两头及两侧下部，加速棚内空气流通，降低棚内温度。
2、配方施肥。促进植株健壮。产区农民多忽视钾肥的使用，而氮肥供应严重超量，这不利于西瓜的健壮生长。应严格按西瓜的需肥规律施肥，氮、磷、钾应按3:1:4的比例配合使用，以促进植株健壮，根系发达，进而提高植株抗逆能力。追肥时严禁使用尿素。
3、推广滴灌技术或小水勤浇。有条件的应逐步推广滴灌技术，无条件的应尽量作窄畦种植，缩小浇水面，减少一次性浇水量。同时应将棚内地面全部用地膜覆盖，减少水分蒸发，进而延长浇水周期和降低棚内湿度。西瓜生长中后期更应小水勤浇，杜绝大水漫灌。
4、整平土地，减少田间积水。西瓜栽植前，应将棚内土地整评，使栽培畦上下游有一定坡降，保证浇水顺畅。下游应设置排水口，浇水时可将多余水排出棚外。这样做既有利于西瓜生长，又可减小棚内湿度，减少西瓜"紫瓤"病的发生。
