水稻南方黑条矮缩病，是由稻飞虱传毒，稻飞虱又是迁飞性害虫，因此，要抓好晚稻秧田及大田前期稻飞虱的防治，预防南方黑条矮缩病、锯齿叶矮缩病发生。
防控措施：要采取“灭虫媒断毒源”、“治秧田保大田”。
一、培育无病秧苗。提倡集中连片育秧，统一防治稻飞虱，减少秧苗获毒机率。
二、药剂防治：抓好“2个6防治”：插前6～10天，大田插后6～10天。
秧苗周围杂草也同时喷药，如发现毒矮株应拔除病株并销毁。药剂选用：亩用10%吡虫啉可湿性粉剂30克（防治白背飞虱），亩用25%吡蚜酮可湿性粉剂16克（防治褐飞虱），亩用25%噻嗪酮（扑虱灵）可湿性粉剂50克(防治褐、白飞虱)，加水50公斤喷雾。
