一、链孢霉。又名脉孢霉。无性阶段属丝孢目，球壳菌科；有性阶段是一种子囊菌。危害菇的是粗糙脉纹孢霉和面包脉纹孢霉。菌丝白色，疏松，有分枝和隔。分生孢子梗为双叉状分枝。分生孢子串生，球形至卵圆形，桔红色或粉红色。子囊壳簇生或散生，近球形或卵形。子囊圆筒形，内有8个子囊孢子。链孢霉分布广泛，空气、土壤、腐烂植物、谷物等可传播。培养料过湿和棉塞受潮时严重发生。可污染所有菇的母种、原种、栽培种及香菇、木耳、银耳的耳棒。被污染的菌种及培养料，初期长出灰白色纤细菌丝，生长迅速，几天后在瓶袋外形成桔红色粉状孢子团，明显高出料面。常常引起成批菌种报废。防治方法是：搞好环境卫生，培养料灭菌要彻底，避免棉塞受潮，搬运时勿损伤菌袋。严格遵守无菌操作规程，培养室避免高温高湿。定期检查，发现孢子团先用湿纸盖住，再运出烧毁。
二、木霉。又名绿霉。丝孢目，丛梗孢科。为害菇的是绿色木霉与康氏木霉。菌丝无色，有隔。分生孢子梗从菌丝侧枝上生出，直立，有隔，小分枝常对生，顶端小梗呈瓶形，上生分生孢子团。分生孢子球形或椭圆形，淡绿色。木霉对菇的危害是：污染培养料，与菇争夺营养；分泌毒素，毒害菇的菌丝；缠绕或切断菇的菌丝。它分布广，是世界性的害菌。为害期长，菇的生长过程都受到侵害。为害程度大，可使整批菇绝收。木霉分布于朽木、植物残体、有机肥、空气和土壤中。培养物碳水化后物过多、偏酸及高温高湿环境有利于其发生。采菇时遗留的残根及易被侵染。防治方法：保持培养室低温、低二氧化碳及通风。选用抗木霉品种。菇房空气湿度勿超过90%。采菇后及时清除残片及根茬。侵染初期，喷0.1%多菌灵液或苯菌灵800倍液。用0.1%多菌灵或甲基托布津拌料，可预防其发生。
三、青霉。也属丝孢目，丛梗孢科。为害菇的是桔青霉、产黄青霉等。菌丝无色或有色，具横隔。分生孢子梗有隔，上生帚状分枝，顶端为小梗，小梗串生分生孢子，分生孢子球形或椭圆形，淡绿色。青霉在很多有机物上均能生长，分生孢子主要靠空气传播，全年均可以生，尤以夏季为重。在被污染的培养料上，形成圆形菌落，深绿至蓝绿色，茸毛状，扩展较慢。菌落较密时连接成片。老菌落常交织在一起，形成膜状物，隔绝料面空气，并分泌毒素，对菌丝有致死作用。它还能诱发菇类病害。防治方法：参见链孢霉与木霉的防治。
四、曲霉。也属丝孢目，丝梗孢科。为害菇的是黑曲霉、黄曲霉和灰绿曲霉等。菌丝无色，有隔。分生孢子梗无隔，无分枝，顶端膨大成球形或椭圆形，放射状密生小梗，分生孢子串生于上，球形或卵形，黑色(黑曲霉)、黄绿色(黄曲霉)或淡绿色(灰绿曲霉)。曲霉分布于土壤、空气及各种有机物上。高温、高湿，通风不良，培养料中碳水化合物过多时易发生。受污染的培养料开始出现白色绒状菌丝，很快即变为有色的粉状霉层。它不仅与菇争夺养料和水分，还分泌毒素，严重影响菇的产量与品质。防治方法：同链孢霉与木霉的防治。
