龙眼花穗按其大小、长短、结果性状等特性，可分为3种类型：
①长花穗：又叫龙头穗或马尾状花穗。其花序主轴明显，长25厘米以上，有10～15枝第一级侧花序，有的多达20枝，两枝侧花序之间相隔距离大。花穗分枝级数越多，花穗越大而长，花量越多且花期早，但坐果率低。
②短花穗：又叫虎头穗或短壮花穗。短花穗是由白露至秋分时抽生的中晚秋梢发育形成的，往往是在花序主轴上产生7～8枝第一级侧花序时，已临近开花期，这样花穗就较短小其长度在15厘米以下。短花穗花期稍迟，花量较少，但雌花比率高，坐果率也高。
③丛状花穗：有些花穗因花序主轴先期受损，因而其下腋间和结果母枝顶芽以下的腋芽抽出丛状多侧花穗。丛状花穗短，花量较少，雌花稍多，坐果较好。
龙眼开花期为4月中旬至5月下旬，依气候、品种、树势、抽穗期而异。较温暖的地区或年份开花早；树势强旺的开花早。单株开花期30～45天，单穗花期则多在20天以上。龙眼的花穗为圆锥形聚伞花序，在主花序和各级侧花序上着生数朵至上千朵花。每一侧花序由很多小花序组成，每个小花序有8朵花，中央1朵先开，旁边2朵后开。龙眼的花蕾60%～90%能正常开花，其余早期脱落。
龙眼主要有雄花、雌花2种，此外还有为数很少的两性花和各种变态花。雄花数量很多，约占总花数的80%，其开放的时间长，开放次数多，一般在开放后1～3天脱落或枯干。雌花外形与雄花相似，但雌蕊发达，雄蕊退化，开放时间短，一般集中开放1～2次。两性花数量很少，其具有正常的雌、雄蕊，花药能散发花粉，子房可发育膨大。龙眼通常是先开雄花，再开雌花，最后以雄花告终。也有的先开雌花，或雌、雄花混开，以雄花结束。龙眼盛花时能分泌大量花蜜，以吸引蜜蜂传粉。
