保护地韭菜由于通风不良，湿度较大，易发生灰霉病，如不及时防治，将严重影响韭菜的产量和品质。
发病特征灰霉病主要危害叶片。可分为白点型、干尖型和湿腐型。白点型和干尖型发病初期在叶片正面或背面生白色或浅灰褐色小斑点，由叶尖向下发展，病斑扩大后呈椭圆形或梭形，可互相汇合成大病斑，致半叶或全叶枯焦。在湿度大时发生湿腐型，叶上不产生白点，枯叶表面密生灰绿色绒毛状霉层，伴有霉味。干尖型由割茬刀口处向下腐烂，初呈水浸状，后变淡绿色，有褐色轮纹，病斑扩散后多呈半圆形或“V”字形，并可向下延伸2~3厘米，表面生灰褐或灰绿色绒毛状霉层。韭菜在贮运中，病叶会出现湿腐型症状，完全湿软腐烂，其表面产生灰霉。
防治方法清理田园：扣棚前和收割后，及时清除病残体，带到棚外深埋或烧毁，防止病菌蔓延。棚内适量通风：通风量根据韭菜长势确定，注意要肩部通风，千万不要通底风。这是防治灰霉病关键措施。培育壮苗：多施有机肥，及时追肥，适量浇水，除草养根，增强植株抗病能力。药剂防治：防重于治，每次收后培土前及发病初期，用50%多菌灵或70%甲基托布津可湿性粉剂500倍液喷淋，必要时选用50%速克灵或50%扑海因或50%农利灵可湿性粉剂1000~1500倍液，每隔7~10天喷1次，连续防治2~3次。湿度大时可采用烟雾法或粉尘法防治，烟雾法可用10%速克灵烟剂，每亩每次250克熏烟，粉尘法用10%灭克粉尘剂，每亩每次1公斤，在傍晚时进行为宜，每隔10天1次，连续或与其他防治法交替防治2~3次。
