雨后或雨水进棚后，形成高温、高湿环境容易诱发多种病害发生。如雨水通过风口或破洞处，或者雨水进棚后，植株茎基部和下部果实会浸泡在雨水中，造成茎部和果实表皮软烂，形成细菌性软腐病。天气转晴后，这些受害植株病部以上会出现失水萎蔫的情况，并且受害果实呈现黑褐色软腐和脱落。受害幼苗植株容易诱发猝倒病、茎基腐病以及绵疫病。由于棚室内的高湿度，部分植株有细菌性斑疹病发生，导致叶片、叶柄、萼片、茎秆等多个出现针尖样黑色小点的危害。进入结果期的植株，受到雨水影响后，也容易诱发根腐病。
因此，棚室内高温、湿度大的环境中，菜农应加强病害的防与治。
一是天气转晴后，及时摘除下部受害果实及叶片。
二是及时喷洒药剂，如细菌性病害可以选择铜制剂、春雷霉素、噻枯唑或中生菌素或噻唑锌等，绵疫病可以选择喷洒烯酰吗啉或霜脲氰或甲霜灵等药剂，根腐病的防治可以在浇水时，随水冲施沃康健组合或选择合理药剂灌根。
三是加强管理。降雨过后，加大通风量，适当遮阳降温，降低棚内湿度，形成良好的棚室环境。同时，对于生长前期的植株，根系范围有限，菜农应及时进行土壤划锄，有利于打破土壤表层的板结，增加土壤水分的蒸腾量，降低土壤湿度。
