碳铵（是碳铵而不是碳氨，又叫碳酸氢铵）是属于铵态氮。铵态氮与石灰混配施入土壤后，容易积累游离氨，抑制了铵态氮的硝化作用（所谓硝化作用是铵态氮的氨，被氧化成硝酸或硝酸盐的过程），从而影响了速效性。
另一方面，也容易导致土壤中的亚硝酸盐含量升高，容易对作物造成不良影响。再一方面，在碱性的环境中，碳铵所分解放出的氨容易挥发损失。至于是否达到对根系造成不良影响，这主要是视施入的量而言。
此外，不知你施入的所谓干石灰有否经过加水后晒干的熟石灰粉，否则如果是生石灰粉，一旦加入的量较大而遇水后则放热量大，是容易对植株幼根造成伤害的。
