由于低温所引起的水稻生理障碍叫冷害。由于发生时期及对水稻生长的影响不同，可分为以下两种：
1、延迟性冷害：这种冷害多发生在分蘖期，主要是低温或冷水灌溉所造成的，其症状是不易分蘖，出穗慢，叶尖干枯，叶脚发黄，稻根发褐，软绵弹性小，新根细而小，生长停滞，致害主要原因是低温抑制了根系活力，影响对无机养分的吸收，同时在水温、土温较低的情况下，土壤微生物不活跃，有机物分解慢，土中有效养分少，故而延迟性冷害常伴有缺氮、缺磷现象。
防治这种冷害的主要措施是增温、促根，可因地制宜浅灌勤晒，迂回灌溉，清除渠道两旁杂草以及深中耕等办法提高水温。土温，疏通土壤空气，促进根系发育。并增施速效性氮、磷肥，促使水稻恢复生长。而根本措施是培育壮秧，掌握适时插秧，坚持浅插，采用带土移栽。
2、障碍性冷害：这种冷害主要是水稻在幼穗分化期或出穗杨花期遇到连续低温，阻碍了花粉粒的正常发育和正常受精结实，形成大量空壳，常使水稻大幅减产。
在幼穗分化期遇到低温，可灌深水护胎，待低温过后，再保持正常水层，要根据天气预报，在“秋早冷”年少种晚熟品种，多种早。中熟品种，并要适期早播，早插，保证水稻在安全抽穗期前抽穗，防止低温对花期的危害。
