在保护地番茄生产中发生较多，畸形果各式各样，形成畸形果的花，萼片和花瓣数量较多，子房形状不正。为降低番茄畸形果的发生率，番茄畸形果的发生症状原因及防治措施如下：
一、症状识别与正常果实形状不一样的果实，均可看作畸形果。常见有：扁圆果、椭圆果、桃形果、尖顶果、突指果、菊形果，以及其他形状的畸形果。
二、病因番茄花芽分化及在花芽发育时遇到5---6℃持续性低温，加上灌水多，抑制幼苗的营养生长，偏施氮肥，花芽过度分化，形成多心皮畸形果，果实呈桃形、瘤形或指形等，如苗龄拉长，低温或干旱持续时间长，幼苗处在抑制生长条件下。花期易木栓化，后转入适宜条件，木栓组织不能适应内部叶肉细胞的迅速生长，则形成裂果、疤果或籽外露果。
三、防治方法育苗时花芽分化前后要加强管理。避免苗期持续性低温，夜温要在8℃以上，至少应避免连续多天和长时间5℃以下低温；合理施肥，避免肥料尤其是氮肥施用量过多，同时要避免苗床过于潮湿，各个花序的第1朵花容易产生重合花，即花朵比一般的萼片、花瓣数量多，心皮也多，往往是几个花芽重合在一起而形成的花，应疏掉；合理使用生长调节剂，不能重复蘸花或一朵花蘸的药液过多。花蕾和未完全开放的花不能蘸。蘸花后，要及时增加肥、水，以保证果实正常生长发育。
