1.入库
一是清杂。贮藏前一个月要将窖内杂物、垃圾彻底清理干净；二是制湿。入窖之前可用水浇窖，相对湿度控制在85-95%之间；三是通气。入窖前10-15天要将贮藏窖的门、窗、通风孔全部打开，充分通风换气；四是消毒。贮前2周左右，将窖内进行消毒处理，用瑞毒霉、多菌灵、百菌清、杀毒矾、甲霜灵锰锌均匀喷洒窖壁四周，并用石灰水喷洒地面，然后打开窖门和通气孔通风2天以上再贮藏薯块。
2.贮藏
降温：种薯入库后，迅速把堆温降到10～12℃，维持相对湿度90%，提供充足的氧气，保持此条件10～14天，使伤口迅速愈合，这样能减轻干腐病的发生。
维持恒温：逐渐把堆温降到3～4℃，并长时间保持，高于4.5℃干腐病菌开始活动，低于2.5℃会降低种薯的生理活性。
升温：在出库前15～20天，逐渐把温度升至10～12℃以打破种薯休眠。
3.出库
主要目标是控制种薯外观质量，对腐烂的马铃薯要集中深埋。
