施有机肥对柑橘类果树而言，一般都宜进行深施的。因为柑橘类果树的吸收根，大多数集中在离开表土约10－50厘米的土壤中。并且，所有的植物的吸收根都有趋肥、趋水的特性。如果将肥料长期通过撤施于树盘表土上，植株的吸收根无疑是会上浮的。在炎热的夏季，表土的温度受阳光的直射时往往会高于自然空间温度，当自然空间温度在35℃以上时，可能表土温度会达到40℃以上。而柑橘类果树最适宜的生长温度一般在23－34℃。
因此，当肥料集中在土壤表面而引起根系上浮后，在温度较高的情况下是容易使根系受损害的。由于有机肥具有肥效长、养分元素齐全，能改善土壤的团粒结结构而提高土壤保肥、保水能力。因此，有机肥宜作为基肥在采果前后或大寒前后，配合适量的化学肥料，在树冠滴水线内外开深沟施下。由于在冬季期间，柑橘类果树植株进入休眠而处于花芽分化的阶段，营养生长变缓，植株所需要的水分大为减少。因此在此时挖沟施肥，断去相当部分的吸收根后，即使遇上雨水较多，天气较暖和的天气条件下，对抑制冬梢的抽发有利。
如果你在采果前后未有对植株进行施有机肥，而在目前进行，那么，宜采用在树冠滴水线下穴施的方式。由于穴施所断去的吸收根较少，对吸收根的影响较少。
