由于菜豆灰霉病侵染快且潜育期长，又易产生抗药性，所以现在主要采用生态防潮、农业防治与化学防治相结合的综合防治措施。
（1）生态防治：大棚、温室采用降低白天温度、提高夜间温度、增加白天通风时间等措施来降低棚内湿度和结露时间，达到控制病害的目的，在菜豆开花结荚期喷施菜果壮蒂灵增强花粉受精质量，循环坐果率强，促进果实发育，无畸形、无空壳、无秕粒，整齐度好、品质提高、使菜果连连丰产。
（2）防止再侵染：应及时摘除病叶、病荚。为避免摘除病叶、病荚时传播病菌，可用塑料小袋套上再摘，连袋集中烧掉或深埋，喷施护树将军杀菌消毒，减少病菌源。
（3）喷药防治：定植开始发现零星病叶即开始喷洒50%速克灵可湿性粉剂1000倍液，或40%菌核净可湿性粉剂1000倍液，或50%扑海因可湿性粉剂1000倍液，结合药剂喷施新高脂膜800倍液提高药剂有效成分利用率，巩固防治效果，隔7-10天喷药一次，连续喷3-4次。
