一、该病害为土传病害，可以随病株体在土壤中长期存活，因此要实行轮作，与水生作物（水稻、马蹄）轮作2-3年。
二、使用生石灰对土壤进行消毒，每亩用量75-100公斤，采用地膜覆盖栽培，提高土温，杀死土壤中的病菌。
三、地下害虫有金龟子，蝼咕，地老虎。主要以幼虫啃食母芋，使母芋表面形成伤口，易被病菌侵入。结合施重肥可选用茶麸、阿维·毒死蜱、阿维·二螓磷等进行防治。
四、将病株和杂草及时清除到田块外烧毁。选择排水良好的田块，施用充分腐熟的有机肥，采用高畦种植，合理密植。禁止在雨天和雾水未干的天气进行农事操作，割仔芋要小心，勿伤母芋，施肥、除草不伤根，避免有伤口侵入为害。
五、芋头软腐病是种传病害，种子带病率很高，因此要做好种子消毒工作，用72%农用链霉素2000倍浸种30分钟，可以有效的消除种子表面的病菌。
