在日光温室种植蔬菜前，要对温室内进行严格消毒，消毒的方法有以下几种:
1.粉尘法。把日光温室建好覆盖薄膜以后，从温室的里端开始喷粉消毒。药剂可选择5%百菌清粉，每亩温室内用药0.75~1公斤，用丰收5型或10型喷粉器，喷粉时要平举喷粉管，5型喷粉器每分钟摇36转左右，10型喷粉器每分钟摇52转左右。喷粉前把温室内密闭，2~3天后打开温室进行农事操作。
2.熏烟法。对于老旧的温室也可用熏烟法进行消毒，可采用45%百菌清烟剂，每亩用药200~250克，把药分成4~5份，按4~5点均匀分布在温室内，用暗火点燃，着烟后，密闭温室。
3.环中菌毒清喷雾法。300倍液的环中菌毒清喷洒温室空间内、地面、立柱、竹竿等，每亩用稀释后的药液25~50公斤。
4.甲醛、高锰酸钾反应法。高锰酸钾与甲醛各0.25公斤，用罐头瓶4~5个，分别放于温室内，用等量的两种药物进行混合，从温室一端开始投入，让其产生消毒气体，进行温室消毒。
