发芽率的高低是衡量韭菜种子质量好坏的重要指标，由于不良气候因素、不正确的采种方法、不正确的贮藏方法或其他人为原因，种植者购买的韭菜种子可能会出现发芽率低的现象，这不仅直接影响出苗的多少，而且还影响出苗后秧苗的长势。有的人把发芽率很低的种子成倍增加播种量进行播种，结果造成种子密度过大，不发芽的种子腐烂引起周围可发芽的好种子一同烂掉，使总的出苗率反倒下降。一般超过常规播种量的50%以上，就可能引起出苗不好。因此，大规模韭菜生产原则上要求使用发芽率高的种子。为了确保使用的韭菜种子具有较高发芽率，在购买种子之后到播种之前，应该进行发芽试验。
测定韭菜种子发芽率的方法有几种。有条件的单位或个人可以采用染色方法或利用发芽盒、培养皿按正规发芽技术要求进行测定。对于一般农户来说，可以拿一定数量的种子先用40°C以下清水浸泡24小时，然后将种子上大部分明水甩掉，再用拧干的湿布包裹几层，放在小碗内，在20°C左右的地方进行催芽，每天用清水投洗一次，甩干继续催芽，这样经过6天检查发芽情况，算出发芽势，12天时再检查一次，计算发芽率。也可以用两块干净的黏土砖用清水浸泡后，代替湿布进行催芽。一般发芽率达到65%以上的种子就可以用来播种。还可以将一定数量的种子浸泡24小时后，按照常规方法直接播种到一小块苗床土壤中，观察出苗情况，这样也能反映出种子发芽质量的好坏。
需要注意的是有的农户用水煮或保温瓶闷的办法测定发芽率，这种做法很不科学，这样催露的芽是靠种皮挤压造成的，不一定有生活力。
还需要说明的是，有些品种的种子在刚采收后的一段时间内处于较深的休眠状态，这时测得的发芽率往往偏低，需要等到种子休眠结束后再测定才会准确。
