控制肥水。进入雨季，棉花即长枝叶又增蕾结铃，对肥水的需求达一生高峰，应适时追肥，谨防脱肥早衰。但由于雨季雨水相对偏丰，极利于各种肥效的发挥而导致棉株旺长、疯长。因而，在追肥的同时还应施足底肥，苗肥量大的棉田应少施或不施，并注意清沟沥水，谨防渍涝。对棉株发育迟缓，红茎到顶，叶小色黄的棉田宜早施并加大肥料用量，主要施尿素。同时遇干旱要及时浇水。
适期控旺。雨季棉株极易发生疯长，引起蕾铃脱落，因此要及时用助壮素+叶面肥控制疯长，改善株型，多增蕾结铃。一般使用时间在雨季初期棉花初开花时进行。
免人工打顶。由于雨季棉株生长加快，其赘芽也易发生。因而，应于雨停间隙及时性时用叶面肥棉花打顶剂喷施顶部代替人工打顶可减少上部无效果枝对养分的无谓消耗，促进棉铃发育等。
防病治虫。干旱不利于棉铃虫卵的孵化和幼虫发育，但降水多雨量大也会阻碍其卵的孵化，尤其是暴雨对虫卵及初孵幼虫有较强的冲刷作用。倘若雨季降水少而均匀，则利于棉铃虫暴发流行。然而，若雨季降水少、干旱严重，则利于红蜘蛛繁衍危害。如果雨季出现连续阴雨，棉株旺长，疯长严重，且田间排水不良，棉株极易患枯、黄萎病，同时又引发烂铃病出现等。因此，结合天气情况，合理选药，科学防治，方能事半功倍。
早防灾害。及早采取措施加以挽救，以减轻危害。如对于冰雹危害后的棉田应及时浇水追肥，促其尽快恢复生机；及时整枝打顶、化控，并注意防治病虫害。对于受涝灾后的棉花，及早清理、疏通排水系统，排除积水，中耕松土，增施肥料，增加抗御能力。
