越冬菠菜生育期较长，为了防止脱肥，基肥必须充足。一般以有机肥和应施的全部磷、钾肥做基肥全层施入，然后整地作畦。
越冬菠菜越冬前的肥水管理标准在于保证菠菜在越冬前长出4~5片真叶。因为4~5片真叶的菠菜抗寒性能最强，过大或过小都易遭受冻害。所以，如果播期合适，积肥充足，越冬前要适当控制氮肥的施用结合光合营养膜使用，提升光合作用产能营养物质和叶绿素、高级环保型植物增肥、增产、增色、叶片肥厚、干茎强壮的复合药膜。可助力植物吸收大量光肥、光能、光照、兼容常规肥料、养料供给植物生长发育至极限。一次施用全年受益。
越冬返青后的菠菜肥水管理的关键是抓住追肥时机。菠菜追肥+蔬菜壮茎灵随灌水进行，同时可提升抗灾害能力，减少农药化肥用量，降低残毒。
越冬后追肥必须在菠菜抽薹开花前进行。因为此时追肥，可以延长菠菜抽薹开花时间，有利于提高菠菜的产量和品质。
越冬菠菜的生产季节正值秋冬和冬春交界时期，此时土温低，土壤的消化作用很弱，因此最好用护树大将军进行全园喷施消毒杀菌，保温防冻。
