一、草莓品种差异：草莓品种之间的结实率有差异，败育率高的畸形果率高。在草莓主栽品种中，宝交早生、丰香、新星二号等多为正常完全花，而有些品种易出现雌蕊长、雄蕊短的花，且花粉粒少而小，多无发芽力，因而易发生畸形果，如达娜等品种。
二、草莓花朵级次：草莓花朵在花序上的着生位置不同，从花序上的第一朵花(顶花)起，随之是第二、三、四朵花，越往后畸形果率越高。草莓花朵级次不同，雌花的育性和花粉的育性不一样，低级次花易出现雄性不育，但只要有良好花粉授粉就可正常坐果发育；而高级次花易出现雌性不育，即使有良好花粉也不能坐果或坐果不良。
三、授粉昆虫数量：保护地草莓的访花昆虫主要有蜜蜂及花蝇、花虻类等。蜜蜂是草莓最重要的访花昆虫。如西安地区正常气候条件下，保护地草莓一般在2月下旬花期自然出现花蝇类，在3月中旬花期自然出现蜜蜂。实践证明，保护地草莓无访花昆虫区的畸形果率比有访花昆虫区高2倍以上。
四、草莓花朵中花蜜和糖的含量：草莓花朵中花蜜和糖的含量低，特别是不良天气导致含糖量降低，不能招引昆虫授粉。
五、温度和湿度原因：当草莓开花时，由于低温、高温或高湿，都易引起畸形果的发生。草莓开花结果期温度在0℃以下可导致花托变黑，如果温度在5℃以下时，会严重影响草莓的生长和授粉。如果温度低于10℃时，不利于草莓花药的开裂、授粉、受精。温度在25℃以上开始影响雌雄蕊发育，40℃以上则花粉发育不良，温度超过45℃花粉粒大量死亡，受精不良。湿度在80%以上的高湿影响草莓花粉开裂，且引起水滴冲刷柱头。
六、草莓管理不当：草莓的底肥中以化肥主为，未施有机肥，在追肥中又偏施氮肥，致使草莓营养生长旺盛，花芽分化过多，弱势花芽多，留果量太大，种苗过小等不当的管理措施都容易造成畸形果的发生。缺少矿质元素如钾、铁、锌、硼等，也易出现畸形果。
七、在草莓花期喷药：由于在草莓花期滥用农药，不仅直接阻碍了受精，而且杀死了蜜蜂等访花昆虫，致使畸形果率明显偏高。在草莓花期喷施有机磷类的农药可使当天和次日开放的花产生畸形果。
