1、减少菌源：一是合理轮作，轻病田可隔年轮作，重病田应实施3年轮作。可用小麦、玉米等禾谷作物倒茬。二是花生生长期和收获后都要及时清楚田间病株残体，减少菌源，控制来年发病。
2、选用抗病品种及提高种子质量：作为种子的花生要及时收获、晒干、妥善储藏、防止霉变。
3、改良土壤：一是不用或少用除草剂，特别是封闭性除草剂，防止土壤板结，增加透气性和透水性；二是深翻平整土地，提高土壤透气性和排水能力；三是增施有机肥，提高地力，增强作物抗性和土壤透气性。
4、科学拌种：科学拌种可以有效防治花生根腐病的发生。拌种效果最好的是使用新高脂膜均匀拌种5公斤—8公斤，凉干后播种，可保温、保湿、吸胀，提高种子发芽率，使幼苗健壮。驱避地下虫害，隔离病毒感染。也可与种衣剂混用。
