病原及侵染对马铃薯能够侵染并且造成损失的病原病毒有马铃薯X病毒、Y病毒等多种。马铃薯花叶病毒(PVX)，是一种长520-550nm的线状病毒，有时在电镜下能看到病毒颗粒的中心孔。在病毒外壳由亚基形成时，可看到它的横纹，这一点是与马铃薯重花叶病毒在形态结构上的主要区别。马铃薯重花叶病毒(PVY)，是一种长680-900nm的线状病毒，在电镜下找不到它的中心孔和外壳蛋白亚基的横纹。它比PVX更细一些、更长一些。此外，还发现了马铃薯S病毒、M病毒、黄矮病毒和类病毒中的马铃薯纤块茎病毒。
对于马铃薯病毒侵染造成马铃薯病毒病的途径，主要是汁液传播。汁液传播的主要媒介是蚜虫。蚜虫有探食性特性，就是说，蚜虫在接触植物(主要是幼嫩叶片)时，首先在着落点吐出唾液，停一会再在有唾液部位，连同刺吸的汁液和唾液一同吸回，最后才确定是否继续吸食下去，正是由于这个特性，病毒在汁液悬浮中就依靠蚜虫这个主要媒介而传播。所以，一般的农药杀蚜，并不能解决蚜传病毒问题。蚜虫被杀死了，病毒也早已传播了。PVX通过汁传后，在马铃薯植株上造成的症状是轻花叶，PVY通过汁液传播后，在马铃薯植株上造成的症状是重花叶，PVX与PVY的重复感染在马铃薯上产生明显的重花叶和斑枯，对产量和品质的影响就严重了。在生产实际中，往往是复合感染，因此，后果严重。成片的马铃薯枯斑坏死是屡见不鲜的。直至收获的块茎都出现肉质褐变。
