本病是世界性的重要病害，其病原菌是棒杆菌属细菌，寄生于蔗株的维管束中。
(1)病状及发病规律
①主要病状：无典型的外部症状，蔗株发育受阻，宿根发株少，蔗株矮化，蔗茎纤弱，生长不良。宿根蔗较新植蔗发病多，矮化严重。病蔗对土壤缺水特别敏感，在炎热的天气比健康蔗株容易表现出受旱症状，如出现萎垂、叶尖和叶缘枯死等。宿根矮化病在蔗茎内部表现出两种类型的变色症状：蔗茎梢头部，生长点之下1厘米的节部组织变成橙红色；成熟蔗茎的节部维管束从黄色变为橙红色以至红褐色，呈逗点状或短线状。节部的维管束变色绝不会延伸至节间。
②发病规律：干旱天气、非灌溉区有利于病害的发生。宿根矮化病传染性很强，病蔗的汁液稀释至10000倍仍具有传染力，受污染的蔗刀置于阴暗处7天仍可传病。病原菌可在甘蔗收获后留做宿根的蔗头中越冬，通过蔗种、砍蔗刀、耕作机具、田间鼠类等啮齿类动物带菌传播。
(2)防治方法
①从无病地区调运蔗种，或在轻病蔗田选择外表健康的甘蔗做种，是预防本病的最好措施。
②用52℃的热水恒温浸种30分钟，或用50℃的热水恒温浸种2小时。
③在育种过程中，砍蔗刀及耕作机具要与其他品种的操作工具分开，分别使用，经常进行消毒处理，并及时消灭田间啮齿类动物。在新品种育成推广后仍继续实行上述措施，以建立无病种苗圃。利用不携带病原的茎尖分生组织经组培工厂化快速繁育后，可获得大量的脱毒健康组培苗，再经一级、二级种苗田繁育后可获得健康种茎供大田生产。
④下种前深耕，精细整地，施足基肥。以后及时追肥，防止干旱，使甘蔗增强抗病力。
⑤宿根矮化病严重的蔗区，要减少宿根蔗的栽培年限和栽培面积。
⑥为防止经过热处理及原来健康的蔗种再度受宿根矮化病的侵染，必须彻底清除育种田的再生蔗，一切用具如砍蔗刀、播种机等使用前必须用沸水、蒸汽或火烤进行消毒。
⑦消灭田鼠和其他咬食甘蔗的啮齿类有害动物，防止病菌传播。
