芒果梢枯流胶病主要危害枝梢、主干，引起枯干，但它也可危害幼苗及果实。幼苗受害多从芽接点或伤口处出现黑褐色坏死斑，很快向上下发展，造成接穗坏死。主干或枝梢受害，皮层坏死呈现溃疡症状，病部流出初为白色后为褐色树胶，病部以上枝梢枯萎，上生黑色小粒点，枯死枝条上的叶褐色，向上翻卷，易落，果实也干缩，一般不脱落。病部下面有时会抽出新枝条，但长势差，叶片褪色。病斑扩展到幼果可使幼果脱落。成熟果受害，初在果蒂出现水状软斑，后扩展成灰褐色大斑，并渗出粘稠汁液，其内果呈褐色软腐。
及早进行预防，在栽培过程中要防止机械损伤和虫害。从健壮母树上取芽条，嫁接刀要用酒精消毒，芽接苗血种植在空气流通的干燥处，特别要保持接口部位干燥，及时对伤口喷施新高脂膜再用麻丝或绳子捆扎，可防氧化，防病菌侵入，制造真空环境抑制津液干枯，提高成活率。结合整形修剪，剪除病枝梢。剪时要从病部以下20-30厘米处剪除；主干上的病斑，要用快刀将病部割除，割至见健康组织，然后将伤口涂上愈伤防腐膜促进伤口快速愈合，避免伤口感染。花期喷杀菌剂。幼果期果实直径约1厘米时可喷杀菌剂+护树大将军消毒杀菌，每隔7-15天喷一次，共喷3次。
