1.全棚消毒处理。清洁田园，特别是将辣椒病株残体彻底清理干净。用护树大将军喷洒地面，可以杀死土壤中残存的病毒、真菌、细菌，有效抑制土传病害的发生。土壤病原菌大多喜欢酸性环境，特别是青枯病原菌，可以根据棚中土壤酸碱度进行适当调整，酸性土壤可亩施60公斤生石灰，改变有害微生物的生活环境，抑制土传病害发生。
2.定植时土壤消毒处理。用新高脂膜加干细土配成药土，在定植时均匀撒于2000棵植株的定植穴内，可有效控制根部病害的蔓延发生。
3.药剂灌根处理。定植缓苗后植株发病，可以采取药剂灌根的防治方法。将根施通配合杀菌剂，进行单株灌根，能诱导病菌集结，供杀菌剂包围歼灭果树根部有害细菌。灌根10天之后方可浇水，否则会加重病害的蔓延发生。
