清除青苔最快最有效的方法是放养前对池塘进行彻底清塘消毒，放养后应慎重使用药物清除青苔，以免影响螺后期生长。
青苔繁殖速度过快，主要和水体透明度过高有关，水体透明度过高，导致青苔光合作用加强，从而促进青苔快速生长，抑制青苔繁殖可采取降低池塘水体透明度的方法抑制青苔的生长，一般可施用一些速效肥（尿素、钙镁磷肥等）。
另外，对于已经存在的青苔，建议采取人工捞除的方法清除。沉性青苔可使用竹竿或木棒将其捞出，浮性青苔可使用草木灰等覆盖抑制其进行光合作用达到杀灭青苔的目的，青苔死亡后应及时捞出，并适量换水。
