佛手瓜最初为弦线状须根，随植株生长，须根逐渐加粗伸长，形成半木质化的侧根，上生不规则的副侧根。侧根长而粗，在一般条件下，一年生的侧根长达2m以上。根系分布范围广，吸收肥水能力强，耐旱。多年生的佛手瓜，进入第2年以后，在不十分炎热的地区可形成肥大的块根。
茎蔓性，攀援性强。主蔓可长达10m以上。分枝能力强，几乎每节上都有分枝，分枝上又有2次、3次分枝。节上着生叶片和卷须。
花、果实、种子：佛手瓜雌雄同株异花，雄花多生于子蔓上，开花早;雌花多生于孙蔓上，开花迟于雄花。雄花10～30朵在总花梗的上部成总状花序，每雄花有雄蕊5枚、花丝联合。雌花单生，枝头头状，花柱联合，子房下位1室、仅具1枚下垂胚珠。弯片、花冠均为5片。异花传粉，虫媒花。
