豌豆具有豆科植物典型的直根系和根瘤菌，有较发达的直根和细长的侧根。豌豆的直根入土深度可达1~2米，但根系主要分布在20厘米深的土层中。侧根较稀，但粗壮，根群主要分布在0～20厘米耕层内。
豌豆主根发育较早，一般在播种后6天就可长到6~8厘米；10天后，幼苗刚出土时就已长出10余条侧根，20天后主根已长达16厘米，并在根部着生根瘤菌。根瘤是好气细菌，它的活动范围主要在耕作层内，因此，根瘤菌大多集中在土表1米以内的根系中。根瘤菌还可于播种前接种到种子上。根瘤的体积越大，发育良好，色泽粉红，固氮的能力就越强，反之则差。
豌豆对土壤贫瘠有较强的忍耐能力。幼苗期根系生长比较慢，开始分化花芽时，根系生长达到高峰期，开花前根系长势迅速减弱，豆荚发育时稍有增强，到豆荚膨大时趋于停止。
