1.猝倒病
此病从播种到成苗均可发生，以2-3片真叶期以前最易发病。种子发芽期染病常引起烂种；幼苗被病菌侵染后，茎基部先出现水渍状病斑，后病斑迅速绕茎一周，变为黄褐色，病部软腐，明显缢缩，病苗往往在子叶凋萎前猝倒。病部表皮极易脱落，维管束缢缩，变成像线一样细。随病害发展病苗迅速向周围扩展，引起成片倒苗。潮湿时，苗床病部附近长出白色棉絮状霉层。
此病为真菌性病害，可用铜铵合剂防治，即硫酸铜1份、碳酸铵2份，磨成粉末混合，放在密闭容器内封存24小时。每次取出铜铵合剂50克冲清水12.5升，喷洒床面。此外适用药剂还有25%瑞毒霉可湿性粉剂800-1000倍、60%杀毒矾可湿性粉剂500倍、72.2%普力克水剂400-600倍、69%安克锰锌水分散粒剂或可湿性粉剂l000-1200倍、80%新万生可湿性粉剂600倍液等。发病初期喷雾或浇淋，每7—10天l次，连喷2-3次。
2.立枯病
此病一般零星发生，个别苗床发病严重，可致瓜苗成片死亡。多在育苗的中后期，或苗床温度较高的棚内发生。主要危害茎基部或根部，最初在茎基部出现椭圆形或不规则形褐色水渍状病斑，以后逐步向下凹陷坏死，绕茎一周后导致茎部萎缩干枯，逐步发展瓜苗萎蔫枯死。根部受害初期皮层变褐色，以后腐烂。发病前期表现白天萎蔫，夜间恢复正常，数日后病苗枯死。本病最后表现为直立枯死，与猝倒病相区别。
此病为真菌性病害，可用种子重量0.3%的45%特克多悬浮剂粘附在种子表面，并拌入少量细土后播种；也可用种子重量0.3%的75%卫福可湿性粉剂或40%拌种双可湿性粉剂或50%利克菌可湿性粉剂或70%土菌消可湿性粉剂拌湿润种子。另外，在发病初期用药剂防治，可用30%倍生乳油1000倍液，或5%井冈霉素水剂1000倍液，或45%特克多悬浮剂1000倍液，或50%扑海因可湿性粉剂1000倍液喷浇茎基部，每7-10天一次，视病情防治2-3次。
3.镰孢霉红粉病
此病从播种到成苗均可发生。种子出苗前染病，大多引起烂种；出苗后发病常从子叶开始侵染，最初在子叶上出现水渍状黄褐色坏死小点，很快变成灰白色至黄褐色近圆形凹陷病斑，边缘水渍状，进一步发展成不规则凹陷斑，其表面产生白色至粉红色霉层。
此病为真菌性病害，可用65%防霉宝可湿性粉剂400倍液或50%多菌灵可湿性粉剂200倍液浸种30分钟。苗床发现病苗要及时拔除并配合药剂防治，可选用65%防霉宝可湿性粉剂600倍液，或50%多菌灵可湿性粉剂500倍液，或10%双效灵水剂1500倍液，或75%敌力脱乳油2000倍液，或2%农抗120水剂200倍液，或45%特克多悬浮剂1000倍液喷雾。
4.红粉病
此病主要发生在生长衰弱或因管理不当瓜苗局部坏死的苗棚。病菌多沿叶缘开始侵染，形成半圆形至不规则形灰绿色至红褐色坏死班，一般较大，以后进一步向叶柄和嫩茎方向侵染，导致幼茎发病，最后瓜苗坏死。潮湿时病组织表面生出白色至粉红色霉层。
此病为真菌性病害，发病时及时清除病苗，并选用80%大生可湿性粉剂800倍液，或40%多硫悬浮剂400倍液，或50%扑海因可湿性粉剂1000倍液，或45%特克多悬浮剂1000倍液喷雾，有条件的可选用上述药剂的粉尘剂喷粉防治。
