秋季是番茄种植的高峰期，秋季温、湿度适宜，利于大部分病虫害发生，因此，我们要做好秋季番茄病虫害的防治。
番茄早疫病：
发病后叶面有同心轮纹状病斑，暗褐色，水渍状。发病前后可用70％代森锰锌可湿性粉剂500倍稀释液，或75％百菌清可湿性粉剂400倍稀释液喷雾，每7天1次，连喷3~4次。
番茄叶霉病：
设施栽培发病较重。发病前后可用70％代森锰锌可湿性粉剂500倍稀释液，或50％速克灵可湿性粉剂800~1000倍稀释液喷雾，每7天1次，连喷3~4次。
番茄灰霉病：
开花期可在蘸花药液中加入0.1％的50％速克灵可湿性粉剂或50％扑海因可湿性粉剂，效果很好。也可对果实喷雾，但应注意轮换用药，防止病菌产生抗药性。还可用50％多克粉尘剂，每亩喷粉1公斤。
番茄病毒病：
发病初期可用20％病毒A可湿性粉剂500倍稀释液，或高锰酸钾1000倍稀释液喷雾，每7天1次，连喷2~3次。
番茄斑枯病：
发病初期可用70％代森锰锌可湿性粉剂500倍稀释液，或50％多菌灵可湿性粉剂500倍稀释液喷雾，每7天1次，连喷3~4次。
番茄虫害：
主要有棉铃虫和蚜虫。棉铃虫应在开花期每隔5~7天喷洒Dr杀虫剂、灭铃虫皇等高效、低毒、低残留杀虫剂，并经常更换施用，蚜虫可用抗蚜威喷雾毒杀。
近年来栽培面积不断扩大。但一些地区的病虫害有逐年上升的趋势，影响了秋番茄的品质和产量，因此，对番茄的病虫害必须提前防治。
