水芹菜在生长期间，尤其是中后期，在叶柄横切面上常出现白点、空心，或叶柄横向、纵向开裂。其出现原因及解决方法如下。
土壤缺硼。这是引起叶柄开裂的主要原因。亩施0.5—1公斤的硼砂作基肥，一旦发现轻微裂柄可用0.2％—0.5％的硼砂水溶液进行叶面喷雾，或用0.25％的硼砂水溶液灌根。
播种期不当或氮肥偏少。露地秋栽的播种过迟，加上氮肥不足，植株长势差，采收季节植株达不到采收标准，而在延迟采收的情况下，易受低温、寒潮的侵袭，叶柄软化，加剧空心现象。因此，各地应根据当地的气候条件、栽培设施确定适宜的播期，并在生长前、中期加强肥水管理，提供充足的氮肥。
植株受冻。西芹不耐严寒。当气温在0℃或0℃以下易出现受冻症状。当植株严重受冻时，叶柄组织结构遭到破坏，在气温回升后，组织不能恢复，细胞间隙增大，从而出现空心。故在栽培过程中应防止受冻，应采用保温措施，避免露地越冬。
品种退化。水芹菜与普通水芹菜易发生天然杂交，所以，水芹菜在留种时必须与其它水芹菜品种严格隔离，同时，在种子生产中，应防止选用一些空心植株留种，以免造成空心植株比例上升。
