食用菌又是一类有机、营养、保健的绿色食品。发展食用菌产业符合人们消费增长和农业可持续发展的需要，是农民快速致富的有效途径。食用菌的早配过程中，防治病虫害是非常关键。
利用害虫的习性进行防冶
1、对菌蚊进行人工捕捉。
2、将发生瘿蚊的菌袋放在阳光下暴晒1-2小时或撒上石灰粉。
水浸法防治
瓶栽和袋栽的可将水注入瓶、袋内，块栽的可将栽培块浸入水中压上重物，浸泡2-3小时。浸泡后的瓶、袋沥干水后放回原处。
诱杀
1、对蚊虫蛾用黑光灯或节能灯诱杀。方法是在灯下的盆内放入0.1%的敌敌畏，害虫落入盆中即被杀死。
2、对黏虫可在强光灯处放置涂抹了40%聚丙乙烯的粘虫板。
曲霉的防治
1、及时清除废料。
2、瓶装料时不能与瓶接相接。装瓶完毕后洗净瓶口除去杂物，保持棉塞清洁。
3、施用5毫克/升的多菌灵，但必须在蘑菇采收完后施用。
绿霉的防治
1、降低菇房的温度和湿度，加大通风量，用草木灰覆压有霉菌的地方，阻止霉菌孢子飞扬。
2、取生石灰9份，多菌灵一份，水适量拌匀，灌刷霉菌处。
3、生料栽培时，每100公斤干料中添加克霉灵100克，可彻底防止霉菌滋生。
4、在霉菌处撒上高锰酸钾颗粒后在其外围喷水。
5、用5%的石灰水浸泡霉菌，待霉菌消失后排除石灰水，补上新料。
6、在霉菌处涂刷95%的酒精或火油，点火将其烧掉，然后挖除，填补新料。
对细菌的防治
1、培养基灭菌要彻底，灭菌时温度、压力、时间要达到要求。
2、培养基做好后，在30℃的培养箱内放置一天后再用，以确保无细菌感染。
3、培养基内可加入抗生素，一般以每毫升100-200单位为宜。
随着人们生活习惯改变，国内市场潜力很大，加之中国又是食用菌出口大国。中国每人每年吃2斤食用菌，就可以增加销售收入80多个亿，由此可看菇类市场将是一个很大的市场。
