根肿病为真菌性病害，幼苗至成株期均可发生，一般在低洼地或水田改旱田后发病重。
发病后期病部易被软腐细菌等侵染，造成组织腐烂或崩溃，散发臭气至全株死亡。
一是农业措施。选用抗根肿病品种。轮作可使病情明显减轻，有条件的地区提倡进行水旱轮作，也可与大葱、韭菜、辣椒等抗耐病蔬菜轮作。根肿菌适宜在偏酸性土壤中生长，可施用消石灰提高土壤的pH值至中性，降低根肿病发病率。
二是种子处理。病区播种前用种子重量0.3％的40％拌种双粉剂拌种。每亩也可用药3-4千克，加40-50千克细土。需要注意的是定植时把药土撒入定植穴内。
三是药剂防治。发病初期浇灌15％恶霉灵水剂500倍液，或70％甲基硫菌灵可湿性粉剂600倍液，隔7天一次，连灌2-3次。
