中国南瓜主蔓发达，早熟品种第十至第十二节着生第一朵雌花，中晚熟品种主蔓第十五节起着生第一朵雌花，其后隔3—4节再现1朵雌花；亦有连续现几朵雌花后隔数节一连发生几朵雌花。第一条侧蔓自第四至第五节发生第一朵雌花，以后每隔6—7节发生1朵雌花。由于南瓜长势较旺，如放任生长，藤叶过于繁茂，易引起徒长、落花落果或僵花僵果，应实施整枝。整枝可以调整植株营养生长和生殖生长的关系，促进结果，增大果体，提高商品性。
南瓜整枝与品种、种植方式、密植程度有关。一般早熟密植栽培应进行严格的整枝；生长势强的中晚熟品种丛植、稀植可采取放任不整枝或多蔓整枝的方式，生产实际中，为了高产，还是采取多蔓整枝为好。露地迟熟栽培整枝方法，一是保留主蔓及基部发生的2—3蔓，其后发生的子蔓和孙蔓均留2叶摘心，自结果节位发生雌花留1叶摘心；二是主蔓5—7叶时摘心，保留3个侧枝，利用子蔓结果。
露地爬地式栽培的整枝方式分为单蔓、双蔓、三蔓等几种方式。该法整枝的植株生长期长、结果期长，结果多，产量高，省工省时，但果实大小不一，整齐度较差。双蔓整枝、三蔓整枝是严格控制蔓数和结果部位的精细栽培，虽较费工但果型较大且整齐，商品性好，可确保果实品质。双蔓整枝有两种方法:一种是保留主蔓，在基部选留1条长势相当的子蔓，其余子孙蔓尽行摘除。因主蔓结果较早，采收期可提前3—5天，另一种是当幼苗具有4—5叶时对主蔓摘心，选留两个生长势相当的子蔓，使其平行生长，争取两条蔓同时结果，果型整齐，便于管理。三蔓整枝是由主蔓和基部选留的2个子蔓构成的三蔓生长。大棚支架密植栽培多数采用单蔓整枝，有利于提高早期产量。
整枝必须与密植结合起来，保持一定蔓数，保证合理叶面积指数，提高单位面积产量。王建堂(1998)以粟南瓜为材料进行支架整枝试验，分单蔓式(15000株/公顷)、双蔓式(7500株/公顷)、三蔓式(5250株/公顷)3个处理；5月25日前的前期产量分别为783千克、726千克和525千克，总产量相应为2879千克、2770千克和2112千克。以密植单蔓整枝、双蔓整枝为优，三蔓整枝的养分分散，瓜蔓长势弱不利于早熟，早期和总产量比较低。
