合理轮作，清理田园及时清除田间前茬病株和病残体，集中烧毁或在大棚闲置期间对土壤进行高温消毒，每亩使用石灰氮120公斤，覆膜浇水后盖严后持续闷棚达25天以上，可有效地对杀灭土壤病菌和虫卵。
高垄地膜栽培，科学浇水施肥根腐病与棚内湿度过大或一次浇水过多有直接关系。为降低棚内湿度，宜采取高垄覆膜栽培，做到膜下浇水并小水勤浇，有条件的最好采取滴灌方式。给草莓选用基肥时，应施用充分腐熟的有机肥，增加生物有机肥的用量，并深翻土壤，提高土壤透气性和缓冲力。
药剂防治草莓根腐病应以预防为主，在定植缓苗期和开花前分别喷施75%百菌清可湿性粉剂500倍至800倍液+新高脂膜800倍液，也可于定植后用普利登鱼蛋白500倍液+根施通灌根，对早期预防根腐病效果明显。对当前已发生根腐病的大棚草莓，应及时拔出病株，并用根施通+普利登鱼蛋白500倍液灌根。
